Skip to main content

Apa itu QMEAN?

Menjawab:

Analisis Model Energi Kualitatif (QMEAN) adalah fungsi penilaian komposit, menggambarkan aspek geometris utama struktur protein.

Penjelasan:

Dalam prediksi struktur protein, sejumlah besar model alternatif biasanya dihasilkan dari mana selanjutnya model akhir harus dipilih. Dengan demikian fungsi penilaian untuk identifikasi model terbaik dalam ansambel model alternatif adalah komponen kunci dari kebanyakan pipa prediksi struktur protein.

Dalam QMEAN beberapa deskriptor struktural yang berbeda digunakan.
Geometri lokal dianalisis dengan jenis potensial sudut torsi baru di atas tiga asam amino berturut-turut.
Potensi tingkat residu berpasangan dengan struktur sekunder yang bergantung pada jarak tertentu digunakan untuk menilai interaksi jarak jauh.
Potensi solvasi menggambarkan status penguburan residu.
Dua istilah sederhana yang menggambarkan perjanjian implementasi yang diprediksi diselidiki dan beberapa pendekatan untuk menggabungkan dan mengoptimalkannya dibahas.

Skor QMEAN dengan demikian digunakan untuk memilih subset dari model yang andal terhadap skor konsensus struktural yang dihitung.