Skip to main content

Bagaimana cara kerja basis data DNA?

Menjawab:

Mereka bekerja seperti basis data lainnya

Penjelasan:

Basis data DNA berfungsi sama seperti basis data lainnya. Itu mereka menyimpan data.

Data pada setiap bagian DNA akan disimpan sebagai catatan, dan catatan tersebut akan berisi bidang yang menyimpan data.

Bidang yang ada tergantung pada database tertentu. Paling tidak akan ada bidang pengidentifikasi unik (ini memberikan nama atau kode unik untuk setiap bagian DNA), dan bidang yang berisi urutan DNA. Namun, mungkin juga ada bidang yang berisi nama organisme dari mana DNA diambil, dan bidang lain yang memberikan informasi yang relevan seperti tanggal sampel diurutkan, nama-nama peneliti yang mengurutkan data, setiap makalah ilmiah terkait , dll.

Bagian yang pintar adalah bagaimana basis data DNA dicari.

Dalam kebanyakan kasus, misalnya ketika kita mencari Google, kita mencari basis data dengan kata kunci. Artinya, kami sedang mencari kecocokan persis dengan kata (untaian huruf) yang kami ketikkan. Namun, dengan basis data DNA jika kami hanya mencari dengan kata kunci, kami hanya akan menemukan kecocokan persis, yaitu kami hanya akan mendapatkan kembali potongan DNA yang sama dari organisme yang sama. Kami hanya akan mencocokkan suka-untuk-suka.

Pencocokan "suka-untuk-suka" ini berarti bahwa hanya akan pernah menemukan sepotong DNA yang sama persis, dan kami tidak akan menemukan urutan terkait dari organisme yang berbeda, atau kami tidak akan menemukan DNA terkait di dalam organisme yang sama (misalnya, kami tidak akan menemukan DNA yang mengkodekan gen yang membentuk keluarga protein).

Untuk menyiasati basis data DNA "seperti-untuk-seperti" ini dicari dengan algoritma "kesamaan". Artinya, ini bukan pencarian yang sama persis. Silakan lihat komentar di bawah untuk contohnya (sistem tidak mengizinkan saya untuk mengetiknya di sini).